Ciao e benvenuto!
Come prima cosa ti consiglierei di presentarti nell'apposita area se non lo hai già fatto ;)
Se hai una r53 (ossia una one d uscita prima del 2006) stai parlando del 1400 rispettivamente da 75cv e 88cv.
Le differenze principali tra questi due motori stanno nella turbina, nella centralina e nello scarico. La 75 cv monta una turbina a geometria fissa, la 88 invece ha una garrett gt1444v a geometria variabile, inoltre lo scarico della 88 cv non ha il pre catalizzatore subito dopo la turbina.
Dunque invece di sostituire il motore con quello della 88 cv il consiglio che ti dò é il solito per un diesel, ossia filtro aria più permeabile, nuova mappa della centralina e scarico.
Se poi miri ad ottenere potenze più elevate puoi far elaborare la turbina sostituendo la girante e montare un intercooler di maggiori dimensioni (se non sbaglio qualcuno qui sul forum lo ha già fatto).
Se invece hai una r56 vale lo stesso discorso, ossia mappatura, filtro e scarico.
In entrambi i casi eviterei l'inutile spesa di sostituire l'intero motore visto che sono molti simili.